core/irrt: split into headers
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518f21d174
commit
58222feed4
@ -1,336 +1,5 @@
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using int8_t = _BitInt(8);
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#include <irrt/int_types.hpp>
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using uint8_t = unsigned _BitInt(8);
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#include <irrt/list.hpp>
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using int32_t = _BitInt(32);
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#include <irrt/math.hpp>
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using uint32_t = unsigned _BitInt(32);
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#include <irrt/ndarray.hpp>
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using int64_t = _BitInt(64);
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#include <irrt/slice.hpp>
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using uint64_t = unsigned _BitInt(64);
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// NDArray indices are always `uint32_t`.
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using NDIndex = uint32_t;
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// The type of an index or a value describing the length of a range/slice is always `int32_t`.
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using SliceIndex = int32_t;
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namespace {
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template<typename T>
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const T& max(const T& a, const T& b) {
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return a > b ? a : b;
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}
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template<typename T>
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const T& min(const T& a, const T& b) {
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return a > b ? b : a;
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}
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// adapted from GNU Scientific Library: https://git.savannah.gnu.org/cgit/gsl.git/tree/sys/pow_int.c
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// need to make sure `exp >= 0` before calling this function
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template<typename T>
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T __nac3_int_exp_impl(T base, T exp) {
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T res = 1;
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/* repeated squaring method */
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do {
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if (exp & 1) {
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res *= base; /* for n odd */
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}
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exp >>= 1;
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base *= base;
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} while (exp);
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return res;
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}
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template<typename SizeT>
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SizeT __nac3_ndarray_calc_size_impl(const SizeT* list_data, SizeT list_len, SizeT begin_idx, SizeT end_idx) {
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__builtin_assume(end_idx <= list_len);
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SizeT num_elems = 1;
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for (SizeT i = begin_idx; i < end_idx; ++i) {
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SizeT val = list_data[i];
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__builtin_assume(val > 0);
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num_elems *= val;
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}
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return num_elems;
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}
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template<typename SizeT>
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void __nac3_ndarray_calc_nd_indices_impl(SizeT index, const SizeT* dims, SizeT num_dims, NDIndex* idxs) {
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SizeT stride = 1;
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for (SizeT dim = 0; dim < num_dims; dim++) {
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SizeT i = num_dims - dim - 1;
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__builtin_assume(dims[i] > 0);
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idxs[i] = (index / stride) % dims[i];
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stride *= dims[i];
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}
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}
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template<typename SizeT>
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SizeT __nac3_ndarray_flatten_index_impl(const SizeT* dims, SizeT num_dims, const NDIndex* indices, SizeT num_indices) {
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SizeT idx = 0;
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SizeT stride = 1;
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for (SizeT i = 0; i < num_dims; ++i) {
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SizeT ri = num_dims - i - 1;
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if (ri < num_indices) {
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idx += stride * indices[ri];
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}
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__builtin_assume(dims[i] > 0);
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stride *= dims[ri];
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}
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return idx;
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}
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template<typename SizeT>
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void __nac3_ndarray_calc_broadcast_impl(const SizeT* lhs_dims,
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SizeT lhs_ndims,
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const SizeT* rhs_dims,
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SizeT rhs_ndims,
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SizeT* out_dims) {
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SizeT max_ndims = lhs_ndims > rhs_ndims ? lhs_ndims : rhs_ndims;
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for (SizeT i = 0; i < max_ndims; ++i) {
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const SizeT* lhs_dim_sz = i < lhs_ndims ? &lhs_dims[lhs_ndims - i - 1] : nullptr;
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||||||
const SizeT* rhs_dim_sz = i < rhs_ndims ? &rhs_dims[rhs_ndims - i - 1] : nullptr;
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||||||
SizeT* out_dim = &out_dims[max_ndims - i - 1];
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if (lhs_dim_sz == nullptr) {
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*out_dim = *rhs_dim_sz;
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||||||
} else if (rhs_dim_sz == nullptr) {
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||||||
*out_dim = *lhs_dim_sz;
|
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||||||
} else if (*lhs_dim_sz == 1) {
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||||||
*out_dim = *rhs_dim_sz;
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||||||
} else if (*rhs_dim_sz == 1) {
|
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||||||
*out_dim = *lhs_dim_sz;
|
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||||||
} else if (*lhs_dim_sz == *rhs_dim_sz) {
|
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||||||
*out_dim = *lhs_dim_sz;
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||||||
} else {
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||||||
__builtin_unreachable();
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||||||
}
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}
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}
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template<typename SizeT>
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void __nac3_ndarray_calc_broadcast_idx_impl(const SizeT* src_dims,
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SizeT src_ndims,
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const NDIndex* in_idx,
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NDIndex* out_idx) {
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for (SizeT i = 0; i < src_ndims; ++i) {
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SizeT src_i = src_ndims - i - 1;
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out_idx[src_i] = src_dims[src_i] == 1 ? 0 : in_idx[src_i];
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}
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}
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} // namespace
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extern "C" {
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#define DEF_nac3_int_exp_(T) \
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T __nac3_int_exp_##T(T base, T exp) { \
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return __nac3_int_exp_impl(base, exp); \
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}
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DEF_nac3_int_exp_(int32_t) DEF_nac3_int_exp_(int64_t) DEF_nac3_int_exp_(uint32_t) DEF_nac3_int_exp_(uint64_t)
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||||||
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||||||
SliceIndex __nac3_slice_index_bound(SliceIndex i, const SliceIndex len) {
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if (i < 0) {
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i = len + i;
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}
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if (i < 0) {
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return 0;
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||||||
} else if (i > len) {
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return len;
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}
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||||||
return i;
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}
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SliceIndex __nac3_range_slice_len(const SliceIndex start, const SliceIndex end, const SliceIndex step) {
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||||||
SliceIndex diff = end - start;
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||||||
if (diff > 0 && step > 0) {
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||||||
return ((diff - 1) / step) + 1;
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||||||
} else if (diff < 0 && step < 0) {
|
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||||||
return ((diff + 1) / step) + 1;
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||||||
} else {
|
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||||||
return 0;
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}
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}
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// Handle list assignment and dropping part of the list when
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// both dest_step and src_step are +1.
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// - All the index must *not* be out-of-bound or negative,
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// - The end index is *inclusive*,
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||||||
// - The length of src and dest slice size should already
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// be checked: if dest.step == 1 then len(src) <= len(dest) else len(src) == len(dest)
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SliceIndex __nac3_list_slice_assign_var_size(SliceIndex dest_start,
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SliceIndex dest_end,
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SliceIndex dest_step,
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uint8_t* dest_arr,
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SliceIndex dest_arr_len,
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||||||
SliceIndex src_start,
|
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||||||
SliceIndex src_end,
|
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||||||
SliceIndex src_step,
|
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||||||
uint8_t* src_arr,
|
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||||||
SliceIndex src_arr_len,
|
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||||||
const SliceIndex size) {
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||||||
/* if dest_arr_len == 0, do nothing since we do not support extending list */
|
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||||||
if (dest_arr_len == 0)
|
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||||||
return dest_arr_len;
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||||||
/* if both step is 1, memmove directly, handle the dropping of the list, and shrink size */
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||||||
if (src_step == dest_step && dest_step == 1) {
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||||||
const SliceIndex src_len = (src_end >= src_start) ? (src_end - src_start + 1) : 0;
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||||||
const SliceIndex dest_len = (dest_end >= dest_start) ? (dest_end - dest_start + 1) : 0;
|
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||||||
if (src_len > 0) {
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||||||
__builtin_memmove(dest_arr + dest_start * size, src_arr + src_start * size, src_len * size);
|
|
||||||
}
|
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||||||
if (dest_len > 0) {
|
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||||||
/* dropping */
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||||||
__builtin_memmove(dest_arr + (dest_start + src_len) * size, dest_arr + (dest_end + 1) * size,
|
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||||||
(dest_arr_len - dest_end - 1) * size);
|
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||||||
}
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||||||
/* shrink size */
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||||||
return dest_arr_len - (dest_len - src_len);
|
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||||||
}
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||||||
/* if two range overlaps, need alloca */
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||||||
uint8_t need_alloca = (dest_arr == src_arr)
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||||||
&& !(max(dest_start, dest_end) < min(src_start, src_end)
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||||||
|| max(src_start, src_end) < min(dest_start, dest_end));
|
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||||||
if (need_alloca) {
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||||||
uint8_t* tmp = reinterpret_cast<uint8_t*>(__builtin_alloca(src_arr_len * size));
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||||||
__builtin_memcpy(tmp, src_arr, src_arr_len * size);
|
|
||||||
src_arr = tmp;
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||||||
}
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||||||
SliceIndex src_ind = src_start;
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||||||
SliceIndex dest_ind = dest_start;
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||||||
for (; (src_step > 0) ? (src_ind <= src_end) : (src_ind >= src_end); src_ind += src_step, dest_ind += dest_step) {
|
|
||||||
/* for constant optimization */
|
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||||||
if (size == 1) {
|
|
||||||
__builtin_memcpy(dest_arr + dest_ind, src_arr + src_ind, 1);
|
|
||||||
} else if (size == 4) {
|
|
||||||
__builtin_memcpy(dest_arr + dest_ind * 4, src_arr + src_ind * 4, 4);
|
|
||||||
} else if (size == 8) {
|
|
||||||
__builtin_memcpy(dest_arr + dest_ind * 8, src_arr + src_ind * 8, 8);
|
|
||||||
} else {
|
|
||||||
/* memcpy for var size, cannot overlap after previous alloca */
|
|
||||||
__builtin_memcpy(dest_arr + dest_ind * size, src_arr + src_ind * size, size);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
}
|
|
||||||
/* only dest_step == 1 can we shrink the dest list. */
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|
||||||
/* size should be ensured prior to calling this function */
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||||||
if (dest_step == 1 && dest_end >= dest_start) {
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||||||
__builtin_memmove(dest_arr + dest_ind * size, dest_arr + (dest_end + 1) * size,
|
|
||||||
(dest_arr_len - dest_end - 1) * size);
|
|
||||||
return dest_arr_len - (dest_end - dest_ind) - 1;
|
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||||||
}
|
|
||||||
return dest_arr_len;
|
|
||||||
}
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||||||
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||||||
int32_t __nac3_isinf(double x) {
|
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||||||
return __builtin_isinf(x);
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||||||
}
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||||||
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||||||
int32_t __nac3_isnan(double x) {
|
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||||||
return __builtin_isnan(x);
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}
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||||||
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double tgamma(double arg);
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||||||
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double __nac3_gamma(double z) {
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// Handling for denormals
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||||||
// | x | Python gamma(x) | C tgamma(x) |
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||||||
// --- | ----------------- | --------------- | ----------- |
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||||||
// (1) | nan | nan | nan |
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||||||
// (2) | -inf | -inf | inf |
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||||||
// (3) | inf | inf | inf |
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||||||
// (4) | 0.0 | inf | inf |
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||||||
// (5) | {-1.0, -2.0, ...} | inf | nan |
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||||||
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||||||
// (1)-(3)
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||||||
if (__builtin_isinf(z) || __builtin_isnan(z)) {
|
|
||||||
return z;
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||||||
}
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||||||
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||||||
double v = tgamma(z);
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||||||
|
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||||||
// (4)-(5)
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||||||
return __builtin_isinf(v) || __builtin_isnan(v) ? __builtin_inf() : v;
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||||||
}
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||||||
|
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||||||
double lgamma(double arg);
|
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||||||
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||||||
double __nac3_gammaln(double x) {
|
|
||||||
// libm's handling of value overflows differs from scipy:
|
|
||||||
// - scipy: gammaln(-inf) -> -inf
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||||||
// - libm : lgamma(-inf) -> inf
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||||||
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||||||
if (__builtin_isinf(x)) {
|
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||||||
return x;
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||||||
}
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||||||
|
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||||||
return lgamma(x);
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||||||
}
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||||||
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||||||
double j0(double x);
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||||||
|
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||||||
double __nac3_j0(double x) {
|
|
||||||
// libm's handling of value overflows differs from scipy:
|
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||||||
// - scipy: j0(inf) -> nan
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|
||||||
// - libm : j0(inf) -> 0.0
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||||||
|
|
||||||
if (__builtin_isinf(x)) {
|
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||||||
return __builtin_nan("");
|
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||||||
}
|
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||||||
|
|
||||||
return j0(x);
|
|
||||||
}
|
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||||||
|
|
||||||
uint32_t __nac3_ndarray_calc_size(const uint32_t* list_data, uint32_t list_len, uint32_t begin_idx, uint32_t end_idx) {
|
|
||||||
return __nac3_ndarray_calc_size_impl(list_data, list_len, begin_idx, end_idx);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
uint64_t
|
|
||||||
__nac3_ndarray_calc_size64(const uint64_t* list_data, uint64_t list_len, uint64_t begin_idx, uint64_t end_idx) {
|
|
||||||
return __nac3_ndarray_calc_size_impl(list_data, list_len, begin_idx, end_idx);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
void __nac3_ndarray_calc_nd_indices(uint32_t index, const uint32_t* dims, uint32_t num_dims, NDIndex* idxs) {
|
|
||||||
__nac3_ndarray_calc_nd_indices_impl(index, dims, num_dims, idxs);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
void __nac3_ndarray_calc_nd_indices64(uint64_t index, const uint64_t* dims, uint64_t num_dims, NDIndex* idxs) {
|
|
||||||
__nac3_ndarray_calc_nd_indices_impl(index, dims, num_dims, idxs);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
uint32_t
|
|
||||||
__nac3_ndarray_flatten_index(const uint32_t* dims, uint32_t num_dims, const NDIndex* indices, uint32_t num_indices) {
|
|
||||||
return __nac3_ndarray_flatten_index_impl(dims, num_dims, indices, num_indices);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
uint64_t
|
|
||||||
__nac3_ndarray_flatten_index64(const uint64_t* dims, uint64_t num_dims, const NDIndex* indices, uint64_t num_indices) {
|
|
||||||
return __nac3_ndarray_flatten_index_impl(dims, num_dims, indices, num_indices);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
void __nac3_ndarray_calc_broadcast(const uint32_t* lhs_dims,
|
|
||||||
uint32_t lhs_ndims,
|
|
||||||
const uint32_t* rhs_dims,
|
|
||||||
uint32_t rhs_ndims,
|
|
||||||
uint32_t* out_dims) {
|
|
||||||
return __nac3_ndarray_calc_broadcast_impl(lhs_dims, lhs_ndims, rhs_dims, rhs_ndims, out_dims);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
void __nac3_ndarray_calc_broadcast64(const uint64_t* lhs_dims,
|
|
||||||
uint64_t lhs_ndims,
|
|
||||||
const uint64_t* rhs_dims,
|
|
||||||
uint64_t rhs_ndims,
|
|
||||||
uint64_t* out_dims) {
|
|
||||||
return __nac3_ndarray_calc_broadcast_impl(lhs_dims, lhs_ndims, rhs_dims, rhs_ndims, out_dims);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
void __nac3_ndarray_calc_broadcast_idx(const uint32_t* src_dims,
|
|
||||||
uint32_t src_ndims,
|
|
||||||
const NDIndex* in_idx,
|
|
||||||
NDIndex* out_idx) {
|
|
||||||
__nac3_ndarray_calc_broadcast_idx_impl(src_dims, src_ndims, in_idx, out_idx);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
void __nac3_ndarray_calc_broadcast_idx64(const uint64_t* src_dims,
|
|
||||||
uint64_t src_ndims,
|
|
||||||
const NDIndex* in_idx,
|
|
||||||
NDIndex* out_idx) {
|
|
||||||
__nac3_ndarray_calc_broadcast_idx_impl(src_dims, src_ndims, in_idx, out_idx);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
} // extern "C"
|
|
||||||
|
|||||||
13
nac3core/irrt/irrt/int_types.hpp
Normal file
13
nac3core/irrt/irrt/int_types.hpp
Normal file
@ -0,0 +1,13 @@
|
|||||||
|
#pragma once
|
||||||
|
|
||||||
|
using int8_t = _BitInt(8);
|
||||||
|
using uint8_t = unsigned _BitInt(8);
|
||||||
|
using int32_t = _BitInt(32);
|
||||||
|
using uint32_t = unsigned _BitInt(32);
|
||||||
|
using int64_t = _BitInt(64);
|
||||||
|
using uint64_t = unsigned _BitInt(64);
|
||||||
|
|
||||||
|
// NDArray indices are always `uint32_t`.
|
||||||
|
using NDIndex = uint32_t;
|
||||||
|
// The type of an index or a value describing the length of a range/slice is always `int32_t`.
|
||||||
|
using SliceIndex = int32_t;
|
||||||
75
nac3core/irrt/irrt/list.hpp
Normal file
75
nac3core/irrt/irrt/list.hpp
Normal file
@ -0,0 +1,75 @@
|
|||||||
|
#pragma once
|
||||||
|
|
||||||
|
#include <irrt/int_types.hpp>
|
||||||
|
#include <irrt/math_util.hpp>
|
||||||
|
|
||||||
|
extern "C" {
|
||||||
|
// Handle list assignment and dropping part of the list when
|
||||||
|
// both dest_step and src_step are +1.
|
||||||
|
// - All the index must *not* be out-of-bound or negative,
|
||||||
|
// - The end index is *inclusive*,
|
||||||
|
// - The length of src and dest slice size should already
|
||||||
|
// be checked: if dest.step == 1 then len(src) <= len(dest) else len(src) == len(dest)
|
||||||
|
SliceIndex __nac3_list_slice_assign_var_size(SliceIndex dest_start,
|
||||||
|
SliceIndex dest_end,
|
||||||
|
SliceIndex dest_step,
|
||||||
|
uint8_t* dest_arr,
|
||||||
|
SliceIndex dest_arr_len,
|
||||||
|
SliceIndex src_start,
|
||||||
|
SliceIndex src_end,
|
||||||
|
SliceIndex src_step,
|
||||||
|
uint8_t* src_arr,
|
||||||
|
SliceIndex src_arr_len,
|
||||||
|
const SliceIndex size) {
|
||||||
|
/* if dest_arr_len == 0, do nothing since we do not support extending list */
|
||||||
|
if (dest_arr_len == 0)
|
||||||
|
return dest_arr_len;
|
||||||
|
/* if both step is 1, memmove directly, handle the dropping of the list, and shrink size */
|
||||||
|
if (src_step == dest_step && dest_step == 1) {
|
||||||
|
const SliceIndex src_len = (src_end >= src_start) ? (src_end - src_start + 1) : 0;
|
||||||
|
const SliceIndex dest_len = (dest_end >= dest_start) ? (dest_end - dest_start + 1) : 0;
|
||||||
|
if (src_len > 0) {
|
||||||
|
__builtin_memmove(dest_arr + dest_start * size, src_arr + src_start * size, src_len * size);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
if (dest_len > 0) {
|
||||||
|
/* dropping */
|
||||||
|
__builtin_memmove(dest_arr + (dest_start + src_len) * size, dest_arr + (dest_end + 1) * size,
|
||||||
|
(dest_arr_len - dest_end - 1) * size);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
/* shrink size */
|
||||||
|
return dest_arr_len - (dest_len - src_len);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
/* if two range overlaps, need alloca */
|
||||||
|
uint8_t need_alloca = (dest_arr == src_arr)
|
||||||
|
&& !(max(dest_start, dest_end) < min(src_start, src_end)
|
||||||
|
|| max(src_start, src_end) < min(dest_start, dest_end));
|
||||||
|
if (need_alloca) {
|
||||||
|
uint8_t* tmp = reinterpret_cast<uint8_t*>(__builtin_alloca(src_arr_len * size));
|
||||||
|
__builtin_memcpy(tmp, src_arr, src_arr_len * size);
|
||||||
|
src_arr = tmp;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
SliceIndex src_ind = src_start;
|
||||||
|
SliceIndex dest_ind = dest_start;
|
||||||
|
for (; (src_step > 0) ? (src_ind <= src_end) : (src_ind >= src_end); src_ind += src_step, dest_ind += dest_step) {
|
||||||
|
/* for constant optimization */
|
||||||
|
if (size == 1) {
|
||||||
|
__builtin_memcpy(dest_arr + dest_ind, src_arr + src_ind, 1);
|
||||||
|
} else if (size == 4) {
|
||||||
|
__builtin_memcpy(dest_arr + dest_ind * 4, src_arr + src_ind * 4, 4);
|
||||||
|
} else if (size == 8) {
|
||||||
|
__builtin_memcpy(dest_arr + dest_ind * 8, src_arr + src_ind * 8, 8);
|
||||||
|
} else {
|
||||||
|
/* memcpy for var size, cannot overlap after previous alloca */
|
||||||
|
__builtin_memcpy(dest_arr + dest_ind * size, src_arr + src_ind * size, size);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
/* only dest_step == 1 can we shrink the dest list. */
|
||||||
|
/* size should be ensured prior to calling this function */
|
||||||
|
if (dest_step == 1 && dest_end >= dest_start) {
|
||||||
|
__builtin_memmove(dest_arr + dest_ind * size, dest_arr + (dest_end + 1) * size,
|
||||||
|
(dest_arr_len - dest_end - 1) * size);
|
||||||
|
return dest_arr_len - (dest_end - dest_ind) - 1;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
return dest_arr_len;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
} // extern "C"
|
||||||
93
nac3core/irrt/irrt/math.hpp
Normal file
93
nac3core/irrt/irrt/math.hpp
Normal file
@ -0,0 +1,93 @@
|
|||||||
|
#pragma once
|
||||||
|
|
||||||
|
namespace {
|
||||||
|
// adapted from GNU Scientific Library: https://git.savannah.gnu.org/cgit/gsl.git/tree/sys/pow_int.c
|
||||||
|
// need to make sure `exp >= 0` before calling this function
|
||||||
|
template<typename T>
|
||||||
|
T __nac3_int_exp_impl(T base, T exp) {
|
||||||
|
T res = 1;
|
||||||
|
/* repeated squaring method */
|
||||||
|
do {
|
||||||
|
if (exp & 1) {
|
||||||
|
res *= base; /* for n odd */
|
||||||
|
}
|
||||||
|
exp >>= 1;
|
||||||
|
base *= base;
|
||||||
|
} while (exp);
|
||||||
|
return res;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
} // namespace
|
||||||
|
|
||||||
|
#define DEF_nac3_int_exp_(T) \
|
||||||
|
T __nac3_int_exp_##T(T base, T exp) { \
|
||||||
|
return __nac3_int_exp_impl(base, exp); \
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
extern "C" {
|
||||||
|
|
||||||
|
// Putting semicolons here to make clang-format not reformat this into
|
||||||
|
// a stair shape.
|
||||||
|
DEF_nac3_int_exp_(int32_t);
|
||||||
|
DEF_nac3_int_exp_(int64_t);
|
||||||
|
DEF_nac3_int_exp_(uint32_t);
|
||||||
|
DEF_nac3_int_exp_(uint64_t);
|
||||||
|
|
||||||
|
int32_t __nac3_isinf(double x) {
|
||||||
|
return __builtin_isinf(x);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
int32_t __nac3_isnan(double x) {
|
||||||
|
return __builtin_isnan(x);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
double tgamma(double arg);
|
||||||
|
|
||||||
|
double __nac3_gamma(double z) {
|
||||||
|
// Handling for denormals
|
||||||
|
// | x | Python gamma(x) | C tgamma(x) |
|
||||||
|
// --- | ----------------- | --------------- | ----------- |
|
||||||
|
// (1) | nan | nan | nan |
|
||||||
|
// (2) | -inf | -inf | inf |
|
||||||
|
// (3) | inf | inf | inf |
|
||||||
|
// (4) | 0.0 | inf | inf |
|
||||||
|
// (5) | {-1.0, -2.0, ...} | inf | nan |
|
||||||
|
|
||||||
|
// (1)-(3)
|
||||||
|
if (__builtin_isinf(z) || __builtin_isnan(z)) {
|
||||||
|
return z;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
double v = tgamma(z);
|
||||||
|
|
||||||
|
// (4)-(5)
|
||||||
|
return __builtin_isinf(v) || __builtin_isnan(v) ? __builtin_inf() : v;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
double lgamma(double arg);
|
||||||
|
|
||||||
|
double __nac3_gammaln(double x) {
|
||||||
|
// libm's handling of value overflows differs from scipy:
|
||||||
|
// - scipy: gammaln(-inf) -> -inf
|
||||||
|
// - libm : lgamma(-inf) -> inf
|
||||||
|
|
||||||
|
if (__builtin_isinf(x)) {
|
||||||
|
return x;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
return lgamma(x);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
double j0(double x);
|
||||||
|
|
||||||
|
double __nac3_j0(double x) {
|
||||||
|
// libm's handling of value overflows differs from scipy:
|
||||||
|
// - scipy: j0(inf) -> nan
|
||||||
|
// - libm : j0(inf) -> 0.0
|
||||||
|
|
||||||
|
if (__builtin_isinf(x)) {
|
||||||
|
return __builtin_nan("");
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
return j0(x);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
13
nac3core/irrt/irrt/math_util.hpp
Normal file
13
nac3core/irrt/irrt/math_util.hpp
Normal file
@ -0,0 +1,13 @@
|
|||||||
|
#pragma once
|
||||||
|
|
||||||
|
namespace {
|
||||||
|
template<typename T>
|
||||||
|
const T& max(const T& a, const T& b) {
|
||||||
|
return a > b ? a : b;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
template<typename T>
|
||||||
|
const T& min(const T& a, const T& b) {
|
||||||
|
return a > b ? b : a;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
} // namespace
|
||||||
144
nac3core/irrt/irrt/ndarray.hpp
Normal file
144
nac3core/irrt/irrt/ndarray.hpp
Normal file
@ -0,0 +1,144 @@
|
|||||||
|
#pragma once
|
||||||
|
|
||||||
|
#include <irrt/int_types.hpp>
|
||||||
|
|
||||||
|
namespace {
|
||||||
|
template<typename SizeT>
|
||||||
|
SizeT __nac3_ndarray_calc_size_impl(const SizeT* list_data, SizeT list_len, SizeT begin_idx, SizeT end_idx) {
|
||||||
|
__builtin_assume(end_idx <= list_len);
|
||||||
|
|
||||||
|
SizeT num_elems = 1;
|
||||||
|
for (SizeT i = begin_idx; i < end_idx; ++i) {
|
||||||
|
SizeT val = list_data[i];
|
||||||
|
__builtin_assume(val > 0);
|
||||||
|
num_elems *= val;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
return num_elems;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
template<typename SizeT>
|
||||||
|
void __nac3_ndarray_calc_nd_indices_impl(SizeT index, const SizeT* dims, SizeT num_dims, NDIndex* idxs) {
|
||||||
|
SizeT stride = 1;
|
||||||
|
for (SizeT dim = 0; dim < num_dims; dim++) {
|
||||||
|
SizeT i = num_dims - dim - 1;
|
||||||
|
__builtin_assume(dims[i] > 0);
|
||||||
|
idxs[i] = (index / stride) % dims[i];
|
||||||
|
stride *= dims[i];
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
template<typename SizeT>
|
||||||
|
SizeT __nac3_ndarray_flatten_index_impl(const SizeT* dims, SizeT num_dims, const NDIndex* indices, SizeT num_indices) {
|
||||||
|
SizeT idx = 0;
|
||||||
|
SizeT stride = 1;
|
||||||
|
for (SizeT i = 0; i < num_dims; ++i) {
|
||||||
|
SizeT ri = num_dims - i - 1;
|
||||||
|
if (ri < num_indices) {
|
||||||
|
idx += stride * indices[ri];
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
__builtin_assume(dims[i] > 0);
|
||||||
|
stride *= dims[ri];
|
||||||
|
}
|
||||||
|
return idx;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
template<typename SizeT>
|
||||||
|
void __nac3_ndarray_calc_broadcast_impl(const SizeT* lhs_dims,
|
||||||
|
SizeT lhs_ndims,
|
||||||
|
const SizeT* rhs_dims,
|
||||||
|
SizeT rhs_ndims,
|
||||||
|
SizeT* out_dims) {
|
||||||
|
SizeT max_ndims = lhs_ndims > rhs_ndims ? lhs_ndims : rhs_ndims;
|
||||||
|
|
||||||
|
for (SizeT i = 0; i < max_ndims; ++i) {
|
||||||
|
const SizeT* lhs_dim_sz = i < lhs_ndims ? &lhs_dims[lhs_ndims - i - 1] : nullptr;
|
||||||
|
const SizeT* rhs_dim_sz = i < rhs_ndims ? &rhs_dims[rhs_ndims - i - 1] : nullptr;
|
||||||
|
SizeT* out_dim = &out_dims[max_ndims - i - 1];
|
||||||
|
|
||||||
|
if (lhs_dim_sz == nullptr) {
|
||||||
|
*out_dim = *rhs_dim_sz;
|
||||||
|
} else if (rhs_dim_sz == nullptr) {
|
||||||
|
*out_dim = *lhs_dim_sz;
|
||||||
|
} else if (*lhs_dim_sz == 1) {
|
||||||
|
*out_dim = *rhs_dim_sz;
|
||||||
|
} else if (*rhs_dim_sz == 1) {
|
||||||
|
*out_dim = *lhs_dim_sz;
|
||||||
|
} else if (*lhs_dim_sz == *rhs_dim_sz) {
|
||||||
|
*out_dim = *lhs_dim_sz;
|
||||||
|
} else {
|
||||||
|
__builtin_unreachable();
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
template<typename SizeT>
|
||||||
|
void __nac3_ndarray_calc_broadcast_idx_impl(const SizeT* src_dims,
|
||||||
|
SizeT src_ndims,
|
||||||
|
const NDIndex* in_idx,
|
||||||
|
NDIndex* out_idx) {
|
||||||
|
for (SizeT i = 0; i < src_ndims; ++i) {
|
||||||
|
SizeT src_i = src_ndims - i - 1;
|
||||||
|
out_idx[src_i] = src_dims[src_i] == 1 ? 0 : in_idx[src_i];
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
} // namespace
|
||||||
|
|
||||||
|
extern "C" {
|
||||||
|
uint32_t __nac3_ndarray_calc_size(const uint32_t* list_data, uint32_t list_len, uint32_t begin_idx, uint32_t end_idx) {
|
||||||
|
return __nac3_ndarray_calc_size_impl(list_data, list_len, begin_idx, end_idx);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
uint64_t
|
||||||
|
__nac3_ndarray_calc_size64(const uint64_t* list_data, uint64_t list_len, uint64_t begin_idx, uint64_t end_idx) {
|
||||||
|
return __nac3_ndarray_calc_size_impl(list_data, list_len, begin_idx, end_idx);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
void __nac3_ndarray_calc_nd_indices(uint32_t index, const uint32_t* dims, uint32_t num_dims, NDIndex* idxs) {
|
||||||
|
__nac3_ndarray_calc_nd_indices_impl(index, dims, num_dims, idxs);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
void __nac3_ndarray_calc_nd_indices64(uint64_t index, const uint64_t* dims, uint64_t num_dims, NDIndex* idxs) {
|
||||||
|
__nac3_ndarray_calc_nd_indices_impl(index, dims, num_dims, idxs);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
uint32_t
|
||||||
|
__nac3_ndarray_flatten_index(const uint32_t* dims, uint32_t num_dims, const NDIndex* indices, uint32_t num_indices) {
|
||||||
|
return __nac3_ndarray_flatten_index_impl(dims, num_dims, indices, num_indices);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
uint64_t
|
||||||
|
__nac3_ndarray_flatten_index64(const uint64_t* dims, uint64_t num_dims, const NDIndex* indices, uint64_t num_indices) {
|
||||||
|
return __nac3_ndarray_flatten_index_impl(dims, num_dims, indices, num_indices);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
void __nac3_ndarray_calc_broadcast(const uint32_t* lhs_dims,
|
||||||
|
uint32_t lhs_ndims,
|
||||||
|
const uint32_t* rhs_dims,
|
||||||
|
uint32_t rhs_ndims,
|
||||||
|
uint32_t* out_dims) {
|
||||||
|
return __nac3_ndarray_calc_broadcast_impl(lhs_dims, lhs_ndims, rhs_dims, rhs_ndims, out_dims);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
void __nac3_ndarray_calc_broadcast64(const uint64_t* lhs_dims,
|
||||||
|
uint64_t lhs_ndims,
|
||||||
|
const uint64_t* rhs_dims,
|
||||||
|
uint64_t rhs_ndims,
|
||||||
|
uint64_t* out_dims) {
|
||||||
|
return __nac3_ndarray_calc_broadcast_impl(lhs_dims, lhs_ndims, rhs_dims, rhs_ndims, out_dims);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
void __nac3_ndarray_calc_broadcast_idx(const uint32_t* src_dims,
|
||||||
|
uint32_t src_ndims,
|
||||||
|
const NDIndex* in_idx,
|
||||||
|
NDIndex* out_idx) {
|
||||||
|
__nac3_ndarray_calc_broadcast_idx_impl(src_dims, src_ndims, in_idx, out_idx);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
void __nac3_ndarray_calc_broadcast_idx64(const uint64_t* src_dims,
|
||||||
|
uint64_t src_ndims,
|
||||||
|
const NDIndex* in_idx,
|
||||||
|
NDIndex* out_idx) {
|
||||||
|
__nac3_ndarray_calc_broadcast_idx_impl(src_dims, src_ndims, in_idx, out_idx);
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
28
nac3core/irrt/irrt/slice.hpp
Normal file
28
nac3core/irrt/irrt/slice.hpp
Normal file
@ -0,0 +1,28 @@
|
|||||||
|
#pragma once
|
||||||
|
|
||||||
|
#include <irrt/int_types.hpp>
|
||||||
|
|
||||||
|
extern "C" {
|
||||||
|
SliceIndex __nac3_slice_index_bound(SliceIndex i, const SliceIndex len) {
|
||||||
|
if (i < 0) {
|
||||||
|
i = len + i;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
if (i < 0) {
|
||||||
|
return 0;
|
||||||
|
} else if (i > len) {
|
||||||
|
return len;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
return i;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
SliceIndex __nac3_range_slice_len(const SliceIndex start, const SliceIndex end, const SliceIndex step) {
|
||||||
|
SliceIndex diff = end - start;
|
||||||
|
if (diff > 0 && step > 0) {
|
||||||
|
return ((diff - 1) / step) + 1;
|
||||||
|
} else if (diff < 0 && step < 0) {
|
||||||
|
return ((diff + 1) / step) + 1;
|
||||||
|
} else {
|
||||||
|
return 0;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
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