unbreak and install spyder
This commit is contained in:
parent
de8b81bd1f
commit
c8c0619b16
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@ -46,7 +46,15 @@
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imagemagick
|
imagemagick
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||||||
firefox
|
firefox
|
||||||
chromium
|
chromium
|
||||||
(python3.withPackages(ps: with ps; [ numpy scipy matplotlib jupyter pyserial artiq.packages.x86_64-linux.artiq ]))
|
(python3.withPackages(ps: with ps; [
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||||||
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numpy
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||||||
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scipy
|
||||||
|
matplotlib
|
||||||
|
jupyter
|
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|
pyserial
|
||||||
|
spyder
|
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artiq.packages.x86_64-linux.artiq
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||||||
|
]))
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||||||
artiq.packages.x86_64-linux.openocd-bscanspi
|
artiq.packages.x86_64-linux.openocd-bscanspi
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texlive.combined.scheme-full
|
texlive.combined.scheme-full
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psmisc
|
psmisc
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||||||
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@ -4,7 +4,7 @@
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||||||
nixosConfigurations.artiq = artiq.inputs.nixpkgs.lib.nixosSystem {
|
nixosConfigurations.artiq = artiq.inputs.nixpkgs.lib.nixosSystem {
|
||||||
system = "x86_64-linux";
|
system = "x86_64-linux";
|
||||||
specialArgs = { inherit artiq; };
|
specialArgs = { inherit artiq; };
|
||||||
modules = [ ./configuration.nix ];
|
modules = [ ./configuration.nix ./spyder ];
|
||||||
};
|
};
|
||||||
};
|
};
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
|
|
||||||
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@ -0,0 +1,31 @@
|
||||||
|
{ lib, fetchPypi, buildPythonPackage, pycodestyle, glibcLocales
|
||||||
|
, toml
|
||||||
|
}:
|
||||||
|
|
||||||
|
buildPythonPackage rec {
|
||||||
|
pname = "autopep8";
|
||||||
|
version = "1.6.0";
|
||||||
|
|
||||||
|
src = fetchPypi {
|
||||||
|
inherit pname version;
|
||||||
|
sha256 = "sha256-RPCTKFUDnSwVxFENbfZl5HMPK4WCcE+kj5xVvT4X2Xk=";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
propagatedBuildInputs = [ pycodestyle toml ];
|
||||||
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# One test fails:
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||||||
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# FAIL: test_recursive_should_not_crash_on_unicode_filename (test.test_autopep8.CommandLineTests)
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# doCheck = false;
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||||||
|
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||||||
|
checkInputs = [ glibcLocales ];
|
||||||
|
|
||||||
|
LC_ALL = "en_US.UTF-8";
|
||||||
|
|
||||||
|
meta = with lib; {
|
||||||
|
description = "A tool that automatically formats Python code to conform to the PEP 8 style guide";
|
||||||
|
homepage = "https://pypi.python.org/pypi/autopep8/";
|
||||||
|
license = licenses.mit;
|
||||||
|
platforms = platforms.all;
|
||||||
|
maintainers = with maintainers; [ bjornfor ];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
@ -0,0 +1,85 @@
|
||||||
|
{ stdenv, lib
|
||||||
|
, buildPythonPackage, fetchPypi, pythonOlder, setuptools-scm, pytestCheckHook
|
||||||
|
, aiohttp
|
||||||
|
, aiohttp-cors
|
||||||
|
, attrs
|
||||||
|
, click
|
||||||
|
, colorama
|
||||||
|
, dataclasses
|
||||||
|
, mypy-extensions
|
||||||
|
, pathspec
|
||||||
|
, parameterized
|
||||||
|
, platformdirs
|
||||||
|
, regex
|
||||||
|
, tomli
|
||||||
|
, typed-ast
|
||||||
|
, typing-extensions
|
||||||
|
, uvloop
|
||||||
|
}:
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
buildPythonPackage rec {
|
||||||
|
pname = "black";
|
||||||
|
version = "22.3.0";
|
||||||
|
|
||||||
|
disabled = pythonOlder "3.6";
|
||||||
|
|
||||||
|
src = fetchPypi {
|
||||||
|
inherit pname version;
|
||||||
|
sha256 = "sha256-NQILiIbAIs7ZKCtRtah1ttGrDDh7MaBluE23wzCFynk=";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
nativeBuildInputs = [ setuptools-scm ];
|
||||||
|
|
||||||
|
# Necessary for the tests to pass on Darwin with sandbox enabled.
|
||||||
|
# Black starts a local server and needs to bind a local address.
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||||||
|
__darwinAllowLocalNetworking = true;
|
||||||
|
|
||||||
|
checkInputs = [ pytestCheckHook parameterized ];
|
||||||
|
|
||||||
|
preCheck = ''
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|
export PATH="$PATH:$out/bin"
|
||||||
|
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||||||
|
# The top directory /build matches black's DEFAULT_EXCLUDE regex.
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||||||
|
# Make /build the project root for black tests to avoid excluding files.
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||||||
|
touch ../.git
|
||||||
|
'' + lib.optionalString stdenv.isDarwin ''
|
||||||
|
# Work around https://github.com/psf/black/issues/2105
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|
export TMPDIR="/tmp"
|
||||||
|
'';
|
||||||
|
|
||||||
|
disabledTests = [
|
||||||
|
# requires network access
|
||||||
|
"test_gen_check_output"
|
||||||
|
] ++ lib.optionals stdenv.isDarwin [
|
||||||
|
# fails on darwin
|
||||||
|
"test_expression_diff"
|
||||||
|
# Fail on Hydra, see https://github.com/NixOS/nixpkgs/pull/130785
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||||||
|
"test_bpo_2142_workaround"
|
||||||
|
"test_skip_magic_trailing_comma"
|
||||||
|
];
|
||||||
|
|
||||||
|
propagatedBuildInputs = [
|
||||||
|
aiohttp
|
||||||
|
aiohttp-cors
|
||||||
|
attrs
|
||||||
|
click
|
||||||
|
colorama
|
||||||
|
mypy-extensions
|
||||||
|
pathspec
|
||||||
|
platformdirs
|
||||||
|
regex
|
||||||
|
tomli
|
||||||
|
typed-ast # required for tests and python2 extra
|
||||||
|
uvloop
|
||||||
|
] ++ lib.optional (pythonOlder "3.7") dataclasses
|
||||||
|
++ lib.optional (pythonOlder "3.8") typing-extensions;
|
||||||
|
|
||||||
|
meta = with lib; {
|
||||||
|
description = "The uncompromising Python code formatter";
|
||||||
|
homepage = "https://github.com/psf/black";
|
||||||
|
changelog = "https://github.com/psf/black/blob/${version}/CHANGES.md";
|
||||||
|
license = licenses.mit;
|
||||||
|
maintainers = with maintainers; [ sveitser autophagy ];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
@ -0,0 +1,23 @@
|
||||||
|
{ config, pkgs, ... }:
|
||||||
|
{
|
||||||
|
# https://github.com/NixOS/nixpkgs/issues/171613
|
||||||
|
nixpkgs.overlays = [ (self: super: rec {
|
||||||
|
python3 = super.python3.override {
|
||||||
|
packageOverrides = pyself: pysuper: {
|
||||||
|
autopep8 = pysuper.pkgs.python3Packages.callPackage ./autopep8 {};
|
||||||
|
black = pysuper.pkgs.python3Packages.callPackage ./black {};
|
||||||
|
ipykernel = pysuper.pkgs.python3Packages.callPackage ./ipykernel {};
|
||||||
|
ipython = pysuper.pkgs.python3Packages.callPackage ./ipython {};
|
||||||
|
jupyter-client = pysuper.pkgs.python3Packages.callPackage ./jupyter-client {};
|
||||||
|
python-lsp-black = pysuper.pkgs.python3Packages.callPackage ./python-lsp-black {};
|
||||||
|
python-lsp-server = pysuper.pkgs.python3Packages.callPackage ./python-lsp-server {};
|
||||||
|
qdarkstyle = pysuper.pkgs.python3Packages.callPackage ./qdarkstyle {};
|
||||||
|
qtconsole = pysuper.pkgs.python3Packages.callPackage ./qtconsole {};
|
||||||
|
qtpy = pysuper.pkgs.python3Packages.callPackage ./qtpy {};
|
||||||
|
spyder-kernels = pysuper.pkgs.python3Packages.callPackage ./spyder-kernels {};
|
||||||
|
spyder = pysuper.pkgs.python3Packages.callPackage ./spyder {};
|
||||||
|
};
|
||||||
|
};
|
||||||
|
python3Packages = python3.pkgs;
|
||||||
|
}) ];
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
@ -0,0 +1,41 @@
|
||||||
|
{ lib
|
||||||
|
, buildPythonPackage
|
||||||
|
, fetchPypi
|
||||||
|
, nose
|
||||||
|
, isPy27
|
||||||
|
, mock
|
||||||
|
, ipython
|
||||||
|
, jupyter-client
|
||||||
|
, pexpect
|
||||||
|
, traitlets
|
||||||
|
, tornado
|
||||||
|
}:
|
||||||
|
|
||||||
|
buildPythonPackage rec {
|
||||||
|
pname = "ipykernel";
|
||||||
|
version = "4.10.1";
|
||||||
|
|
||||||
|
src = fetchPypi {
|
||||||
|
inherit pname version;
|
||||||
|
sha256 = "eeb74b2bcfe0ced5a7900361f98fa1171288aa47ed4b522efe5acb167c6cf5fb";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
checkInputs = [ nose ] ++ lib.optional isPy27 mock;
|
||||||
|
propagatedBuildInputs = [
|
||||||
|
ipython
|
||||||
|
jupyter-client
|
||||||
|
pexpect
|
||||||
|
traitlets
|
||||||
|
tornado
|
||||||
|
];
|
||||||
|
|
||||||
|
# Tests require backends.
|
||||||
|
# I don't want to add all supported backends as propagatedBuildInputs
|
||||||
|
doCheck = false;
|
||||||
|
|
||||||
|
meta = {
|
||||||
|
description = "IPython Kernel for Jupyter";
|
||||||
|
homepage = "http://ipython.org/";
|
||||||
|
license = lib.licenses.bsd3;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
@ -0,0 +1,50 @@
|
||||||
|
{ lib
|
||||||
|
, buildPythonPackage
|
||||||
|
, callPackage
|
||||||
|
, fetchPypi
|
||||||
|
, pythonOlder
|
||||||
|
, argcomplete
|
||||||
|
, debugpy
|
||||||
|
, ipython
|
||||||
|
, jupyter-client
|
||||||
|
, tornado
|
||||||
|
, traitlets
|
||||||
|
, psutil
|
||||||
|
, packaging
|
||||||
|
}:
|
||||||
|
|
||||||
|
buildPythonPackage rec {
|
||||||
|
pname = "ipykernel";
|
||||||
|
version = "6.13.0";
|
||||||
|
|
||||||
|
src = fetchPypi {
|
||||||
|
inherit pname version;
|
||||||
|
sha256 = "sha256-DignPikIWDk+huFSsQTlUGp5wT0luVGsbsoiAFG0vmA=";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
propagatedBuildInputs = [
|
||||||
|
debugpy
|
||||||
|
ipython
|
||||||
|
jupyter-client
|
||||||
|
tornado
|
||||||
|
traitlets
|
||||||
|
psutil
|
||||||
|
packaging
|
||||||
|
] ++ lib.optionals (pythonOlder "3.8") [
|
||||||
|
argcomplete
|
||||||
|
];
|
||||||
|
|
||||||
|
# check in passthru.tests.pytest to escape infinite recursion with ipyparallel
|
||||||
|
doCheck = false;
|
||||||
|
|
||||||
|
passthru.tests = {
|
||||||
|
pytest = callPackage ./tests.nix { };
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
meta = {
|
||||||
|
description = "IPython Kernel for Jupyter";
|
||||||
|
homepage = "http://ipython.org/";
|
||||||
|
license = lib.licenses.bsd3;
|
||||||
|
maintainers = with lib.maintainers; [ fridh ];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
@ -0,0 +1,57 @@
|
||||||
|
{ lib
|
||||||
|
, stdenv
|
||||||
|
, buildPythonPackage
|
||||||
|
, pythonOlder
|
||||||
|
, flaky
|
||||||
|
, ipykernel
|
||||||
|
, ipyparallel
|
||||||
|
, nose
|
||||||
|
, pytestCheckHook
|
||||||
|
|
||||||
|
}:
|
||||||
|
|
||||||
|
buildPythonPackage rec {
|
||||||
|
pname = "ipykernel-tests";
|
||||||
|
inherit (ipykernel) version;
|
||||||
|
|
||||||
|
src = ipykernel.src;
|
||||||
|
|
||||||
|
dontBuild = true;
|
||||||
|
dontInstall = true;
|
||||||
|
|
||||||
|
checkInputs = [
|
||||||
|
flaky
|
||||||
|
ipykernel
|
||||||
|
ipyparallel
|
||||||
|
nose
|
||||||
|
pytestCheckHook
|
||||||
|
];
|
||||||
|
|
||||||
|
preCheck = ''
|
||||||
|
export HOME=$(mktemp -d)
|
||||||
|
'';
|
||||||
|
|
||||||
|
disabledTests = lib.optionals stdenv.isDarwin ([
|
||||||
|
# see https://github.com/NixOS/nixpkgs/issues/76197
|
||||||
|
"test_subprocess_print"
|
||||||
|
"test_subprocess_error"
|
||||||
|
"test_ipython_start_kernel_no_userns"
|
||||||
|
|
||||||
|
# https://github.com/ipython/ipykernel/issues/506
|
||||||
|
"test_unc_paths"
|
||||||
|
] ++ lib.optionals (pythonOlder "3.8") [
|
||||||
|
# flaky test https://github.com/ipython/ipykernel/issues/485
|
||||||
|
"test_shutdown"
|
||||||
|
|
||||||
|
# test regression https://github.com/ipython/ipykernel/issues/486
|
||||||
|
"test_sys_path_profile_dir"
|
||||||
|
"test_save_history"
|
||||||
|
"test_help_output"
|
||||||
|
"test_write_kernel_spec"
|
||||||
|
"test_ipython_start_kernel_userns"
|
||||||
|
"ZMQDisplayPublisherTests"
|
||||||
|
]);
|
||||||
|
|
||||||
|
# Some of the tests use localhost networking.
|
||||||
|
__darwinAllowLocalNetworking = true;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
@ -0,0 +1,72 @@
|
||||||
|
{ lib
|
||||||
|
, stdenv
|
||||||
|
, buildPythonPackage
|
||||||
|
, fetchPypi
|
||||||
|
, fetchpatch
|
||||||
|
# Build dependencies
|
||||||
|
, glibcLocales
|
||||||
|
# Test dependencies
|
||||||
|
, nose
|
||||||
|
, pygments
|
||||||
|
, testpath
|
||||||
|
, isPy27
|
||||||
|
, mock
|
||||||
|
# Runtime dependencies
|
||||||
|
, backports_shutil_get_terminal_size
|
||||||
|
, decorator
|
||||||
|
, pathlib2
|
||||||
|
, pickleshare
|
||||||
|
, requests
|
||||||
|
, simplegeneric
|
||||||
|
, traitlets
|
||||||
|
, prompt-toolkit
|
||||||
|
, pexpect
|
||||||
|
, appnope
|
||||||
|
}:
|
||||||
|
|
||||||
|
buildPythonPackage rec {
|
||||||
|
pname = "ipython";
|
||||||
|
version = "5.8.0";
|
||||||
|
|
||||||
|
src = fetchPypi {
|
||||||
|
inherit pname version;
|
||||||
|
sha256 = "4bac649857611baaaf76bc82c173aa542f7486446c335fe1a6c05d0d491c8906";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
prePatch = lib.optionalString stdenv.isDarwin ''
|
||||||
|
substituteInPlace setup.py --replace "'gnureadline'" " "
|
||||||
|
'';
|
||||||
|
|
||||||
|
patches = [
|
||||||
|
# Use the proper pygments lexer for python2 (https://github.com/ipython/ipython/pull/12095)
|
||||||
|
(fetchpatch {
|
||||||
|
name = "python2-lexer.patch";
|
||||||
|
url = "https://github.com/ipython/ipython/pull/12095/commits/8805293b5e4bce9150cc2ad9c5d6d984849ae447.patch";
|
||||||
|
sha256 = "16p4gl7a49v76w33j39ih7yspy6x2d14p9bh4wdpg9cafhw9nbc0";
|
||||||
|
})
|
||||||
|
];
|
||||||
|
|
||||||
|
buildInputs = [ glibcLocales ];
|
||||||
|
|
||||||
|
checkInputs = [ nose pygments testpath ] ++ lib.optional isPy27 mock;
|
||||||
|
|
||||||
|
propagatedBuildInputs = [
|
||||||
|
backports_shutil_get_terminal_size decorator pickleshare prompt-toolkit
|
||||||
|
simplegeneric traitlets requests pathlib2 pexpect
|
||||||
|
] ++ lib.optionals stdenv.isDarwin [ appnope ];
|
||||||
|
|
||||||
|
LC_ALL="en_US.UTF-8";
|
||||||
|
|
||||||
|
doCheck = false; # Circular dependency with ipykernel
|
||||||
|
|
||||||
|
checkPhase = ''
|
||||||
|
nosetests
|
||||||
|
'';
|
||||||
|
|
||||||
|
meta = {
|
||||||
|
description = "IPython: Productive Interactive Computing";
|
||||||
|
homepage = "http://ipython.org/";
|
||||||
|
license = lib.licenses.bsd3;
|
||||||
|
maintainers = with lib.maintainers; [ bjornfor orivej lnl7 ];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
@ -0,0 +1,69 @@
|
||||||
|
{ lib
|
||||||
|
, stdenv
|
||||||
|
, buildPythonPackage
|
||||||
|
, fetchPypi
|
||||||
|
, pythonOlder
|
||||||
|
# Build dependencies
|
||||||
|
, glibcLocales
|
||||||
|
# Test dependencies
|
||||||
|
, nose
|
||||||
|
, pygments
|
||||||
|
# Runtime dependencies
|
||||||
|
, jedi
|
||||||
|
, decorator
|
||||||
|
, pickleshare
|
||||||
|
, traitlets
|
||||||
|
, prompt-toolkit
|
||||||
|
, pexpect
|
||||||
|
, appnope
|
||||||
|
, backcall
|
||||||
|
}:
|
||||||
|
|
||||||
|
buildPythonPackage rec {
|
||||||
|
pname = "ipython";
|
||||||
|
version = "7.16.1";
|
||||||
|
disabled = pythonOlder "3.6";
|
||||||
|
|
||||||
|
src = fetchPypi {
|
||||||
|
inherit pname version;
|
||||||
|
sha256 = "9f4fcb31d3b2c533333893b9172264e4821c1ac91839500f31bd43f2c59b3ccf";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
prePatch = lib.optionalString stdenv.isDarwin ''
|
||||||
|
substituteInPlace setup.py --replace "'gnureadline'" " "
|
||||||
|
'';
|
||||||
|
|
||||||
|
buildInputs = [ glibcLocales ];
|
||||||
|
|
||||||
|
checkInputs = [ nose pygments ];
|
||||||
|
|
||||||
|
propagatedBuildInputs = [
|
||||||
|
jedi
|
||||||
|
decorator
|
||||||
|
pickleshare
|
||||||
|
traitlets
|
||||||
|
prompt-toolkit
|
||||||
|
pygments
|
||||||
|
pexpect
|
||||||
|
backcall
|
||||||
|
] ++ lib.optionals stdenv.isDarwin [appnope];
|
||||||
|
|
||||||
|
LC_ALL="en_US.UTF-8";
|
||||||
|
|
||||||
|
doCheck = false; # Circular dependency with ipykernel
|
||||||
|
|
||||||
|
checkPhase = ''
|
||||||
|
nosetests
|
||||||
|
'';
|
||||||
|
|
||||||
|
pythonImportsCheck = [
|
||||||
|
"IPython"
|
||||||
|
];
|
||||||
|
|
||||||
|
meta = with lib; {
|
||||||
|
description = "IPython: Productive Interactive Computing";
|
||||||
|
homepage = "http://ipython.org/";
|
||||||
|
license = licenses.bsd3;
|
||||||
|
maintainers = with maintainers; [ bjornfor fridh ];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
@ -0,0 +1,73 @@
|
||||||
|
{ lib
|
||||||
|
, stdenv
|
||||||
|
, buildPythonPackage
|
||||||
|
, fetchPypi
|
||||||
|
, fetchpatch
|
||||||
|
, pythonOlder
|
||||||
|
# Build dependencies
|
||||||
|
, glibcLocales
|
||||||
|
# Test dependencies
|
||||||
|
, nose
|
||||||
|
, pygments
|
||||||
|
# Runtime dependencies
|
||||||
|
, jedi
|
||||||
|
, decorator
|
||||||
|
, matplotlib-inline
|
||||||
|
, pickleshare
|
||||||
|
, traitlets
|
||||||
|
, prompt-toolkit
|
||||||
|
, pexpect
|
||||||
|
, appnope
|
||||||
|
, backcall
|
||||||
|
, pytest
|
||||||
|
}:
|
||||||
|
|
||||||
|
buildPythonPackage rec {
|
||||||
|
pname = "ipython";
|
||||||
|
version = "7.33.0";
|
||||||
|
disabled = pythonOlder "3.7";
|
||||||
|
|
||||||
|
src = fetchPypi {
|
||||||
|
inherit pname version;
|
||||||
|
sha256 = "sha256-vP+4Zag7CBYgMBug7E2VCERU8muR1tZrR1v/PfsCGNQ=";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
prePatch = lib.optionalString stdenv.isDarwin ''
|
||||||
|
substituteInPlace setup.py --replace "'gnureadline'" " "
|
||||||
|
'';
|
||||||
|
|
||||||
|
buildInputs = [ glibcLocales ];
|
||||||
|
|
||||||
|
propagatedBuildInputs = [
|
||||||
|
jedi
|
||||||
|
decorator
|
||||||
|
matplotlib-inline
|
||||||
|
pickleshare
|
||||||
|
traitlets
|
||||||
|
prompt-toolkit
|
||||||
|
pygments
|
||||||
|
pexpect
|
||||||
|
backcall
|
||||||
|
] ++ lib.optionals stdenv.isDarwin [appnope];
|
||||||
|
|
||||||
|
LC_ALL="en_US.UTF-8";
|
||||||
|
|
||||||
|
# full tests normally disabled due to a circular dependency with
|
||||||
|
# ipykernel, but we want to test the CVE-2022-21699 fix in this
|
||||||
|
# branch
|
||||||
|
checkInputs = [ pytest ];
|
||||||
|
checkPhase = ''
|
||||||
|
pytest IPython/tests/cve.py
|
||||||
|
'';
|
||||||
|
|
||||||
|
pythonImportsCheck = [
|
||||||
|
"IPython"
|
||||||
|
];
|
||||||
|
|
||||||
|
meta = with lib; {
|
||||||
|
description = "IPython: Productive Interactive Computing";
|
||||||
|
homepage = "http://ipython.org/";
|
||||||
|
license = licenses.bsd3;
|
||||||
|
maintainers = with maintainers; [ bjornfor fridh ];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
@ -0,0 +1,40 @@
|
||||||
|
{ lib
|
||||||
|
, buildPythonPackage
|
||||||
|
, fetchPypi
|
||||||
|
, traitlets
|
||||||
|
, jupyter_core
|
||||||
|
, pyzmq
|
||||||
|
, python-dateutil
|
||||||
|
, isPyPy
|
||||||
|
, py
|
||||||
|
, tornado
|
||||||
|
}:
|
||||||
|
|
||||||
|
buildPythonPackage rec {
|
||||||
|
pname = "jupyter-client";
|
||||||
|
version = "5.3.5";
|
||||||
|
|
||||||
|
src = fetchPypi {
|
||||||
|
pname = "jupyter_client";
|
||||||
|
inherit version;
|
||||||
|
sha256 = "5efdf4131124d4a0d5789101e74827022585f172d2f4b60cf6fa98e0a7511b25";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
propagatedBuildInputs = [
|
||||||
|
traitlets
|
||||||
|
jupyter_core
|
||||||
|
pyzmq
|
||||||
|
python-dateutil
|
||||||
|
tornado
|
||||||
|
] ++ lib.optional isPyPy py;
|
||||||
|
|
||||||
|
# Circular dependency with ipykernel
|
||||||
|
doCheck = false;
|
||||||
|
|
||||||
|
meta = {
|
||||||
|
description = "Jupyter protocol implementation and client libraries";
|
||||||
|
homepage = "https://jupyter.org/";
|
||||||
|
license = lib.licenses.bsd3;
|
||||||
|
maintainers = with lib.maintainers; [ ];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
@ -0,0 +1,43 @@
|
||||||
|
{ lib
|
||||||
|
, buildPythonPackage
|
||||||
|
, fetchPypi
|
||||||
|
, entrypoints
|
||||||
|
, jupyter_core
|
||||||
|
, nest-asyncio
|
||||||
|
, python-dateutil
|
||||||
|
, pyzmq
|
||||||
|
, tornado
|
||||||
|
, traitlets
|
||||||
|
, isPyPy
|
||||||
|
, py
|
||||||
|
}:
|
||||||
|
|
||||||
|
buildPythonPackage rec {
|
||||||
|
pname = "jupyter_client";
|
||||||
|
version = "7.1.0";
|
||||||
|
|
||||||
|
src = fetchPypi {
|
||||||
|
inherit pname version;
|
||||||
|
sha256 = "sha256-pfmVpzz/sxTtJicTrm385TxrghbOqfMyBxuP9EpuFlQ=";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
propagatedBuildInputs = [
|
||||||
|
entrypoints
|
||||||
|
jupyter_core
|
||||||
|
nest-asyncio
|
||||||
|
python-dateutil
|
||||||
|
pyzmq
|
||||||
|
tornado
|
||||||
|
traitlets
|
||||||
|
] ++ lib.optional isPyPy py;
|
||||||
|
|
||||||
|
# Circular dependency with ipykernel
|
||||||
|
doCheck = false;
|
||||||
|
|
||||||
|
meta = {
|
||||||
|
description = "Jupyter protocol implementation and client libraries";
|
||||||
|
homepage = "https://jupyter.org/";
|
||||||
|
license = lib.licenses.bsd3;
|
||||||
|
maintainers = with lib.maintainers; [ fridh ];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
@ -0,0 +1,32 @@
|
||||||
|
{ lib
|
||||||
|
, black
|
||||||
|
, buildPythonPackage
|
||||||
|
, fetchFromGitHub
|
||||||
|
, pytestCheckHook
|
||||||
|
, python-lsp-server
|
||||||
|
, pythonOlder
|
||||||
|
}:
|
||||||
|
|
||||||
|
buildPythonPackage rec {
|
||||||
|
pname = "python-lsp-black";
|
||||||
|
version = "1.2.1";
|
||||||
|
disabled = pythonOlder "3.6";
|
||||||
|
|
||||||
|
src = fetchFromGitHub {
|
||||||
|
owner = "python-lsp";
|
||||||
|
repo = "python-lsp-black";
|
||||||
|
rev = "v${version}";
|
||||||
|
sha256 = "sha256-qNA6Bj1VI0YEtRuvcMQZGWakQNNrJ2PqhozrLmQHPAg=";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
checkInputs = [ pytestCheckHook ];
|
||||||
|
|
||||||
|
propagatedBuildInputs = [ black python-lsp-server ];
|
||||||
|
|
||||||
|
meta = with lib; {
|
||||||
|
homepage = "https://github.com/python-lsp/python-lsp-black";
|
||||||
|
description = "Black plugin for the Python LSP Server";
|
||||||
|
license = licenses.mit;
|
||||||
|
maintainers = with maintainers; [ cpcloud ];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
@ -0,0 +1,108 @@
|
||||||
|
{ lib
|
||||||
|
, autopep8
|
||||||
|
, buildPythonPackage
|
||||||
|
, fetchPypi
|
||||||
|
, flake8
|
||||||
|
, flaky
|
||||||
|
, jedi
|
||||||
|
, matplotlib
|
||||||
|
, mccabe
|
||||||
|
, numpy
|
||||||
|
, pandas
|
||||||
|
, pluggy
|
||||||
|
, pycodestyle
|
||||||
|
, pydocstyle
|
||||||
|
, pyflakes
|
||||||
|
, pylint
|
||||||
|
, pyqt5
|
||||||
|
, pytestCheckHook
|
||||||
|
, python-lsp-jsonrpc
|
||||||
|
, pythonOlder
|
||||||
|
, rope
|
||||||
|
, setuptools
|
||||||
|
, setuptools_scm
|
||||||
|
, ujson
|
||||||
|
, yapf
|
||||||
|
, withAutopep8 ? true
|
||||||
|
, withFlake8 ? true
|
||||||
|
, withMccabe ? true
|
||||||
|
, withPycodestyle ? true
|
||||||
|
, withPydocstyle ? true
|
||||||
|
, withPyflakes ? true
|
||||||
|
, withPylint ? true
|
||||||
|
, withRope ? true
|
||||||
|
, withYapf ? true
|
||||||
|
}:
|
||||||
|
|
||||||
|
buildPythonPackage rec {
|
||||||
|
pname = "python-lsp-server";
|
||||||
|
version = "1.4.1";
|
||||||
|
disabled = pythonOlder "3.6";
|
||||||
|
|
||||||
|
src = fetchPypi {
|
||||||
|
pname = "python-lsp-server";
|
||||||
|
inherit version;
|
||||||
|
sha256 = "sha256-vn+DKYr58JUak5csr8nbBP189cBfIIElFSdfC6cONC8=";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
postPatch = ''
|
||||||
|
substituteInPlace setup.cfg \
|
||||||
|
--replace "--cov-report html --cov-report term --junitxml=pytest.xml" "" \
|
||||||
|
--replace "--cov pylsp --cov test" ""
|
||||||
|
'';
|
||||||
|
|
||||||
|
propagatedBuildInputs = [
|
||||||
|
jedi
|
||||||
|
pluggy
|
||||||
|
python-lsp-jsonrpc
|
||||||
|
setuptools
|
||||||
|
setuptools_scm
|
||||||
|
ujson
|
||||||
|
] ++ lib.optional withAutopep8 autopep8
|
||||||
|
++ lib.optional withFlake8 flake8
|
||||||
|
++ lib.optional withMccabe mccabe
|
||||||
|
++ lib.optional withPycodestyle pycodestyle
|
||||||
|
++ lib.optional withPydocstyle pydocstyle
|
||||||
|
++ lib.optional withPyflakes pyflakes
|
||||||
|
++ lib.optional withPylint pylint
|
||||||
|
++ lib.optional withRope rope
|
||||||
|
++ lib.optional withYapf yapf;
|
||||||
|
|
||||||
|
checkInputs = [
|
||||||
|
flaky
|
||||||
|
matplotlib
|
||||||
|
numpy
|
||||||
|
pandas
|
||||||
|
pyqt5
|
||||||
|
pytestCheckHook
|
||||||
|
];
|
||||||
|
|
||||||
|
disabledTests = [
|
||||||
|
# pytlint output changed
|
||||||
|
"test_lint_free_pylint"
|
||||||
|
] ++ lib.optional (!withPycodestyle) "test_workspace_loads_pycodestyle_config";
|
||||||
|
|
||||||
|
disabledTestPaths = lib.optional (!withAutopep8) "test/plugins/test_autopep8_format.py"
|
||||||
|
++ lib.optional (!withRope) "test/plugins/test_completion.py"
|
||||||
|
++ lib.optional (!withFlake8) "test/plugins/test_flake8_lint.py"
|
||||||
|
++ lib.optional (!withMccabe) "test/plugins/test_mccabe_lint.py"
|
||||||
|
++ lib.optional (!withPycodestyle) "test/plugins/test_pycodestyle_lint.py"
|
||||||
|
++ lib.optional (!withPydocstyle) "test/plugins/test_pydocstyle_lint.py"
|
||||||
|
++ lib.optional (!withPyflakes) "test/plugins/test_pyflakes_lint.py"
|
||||||
|
++ lib.optional (!withPylint) "test/plugins/test_pylint_lint.py"
|
||||||
|
++ lib.optional (!withRope) "test/plugins/test_rope_rename.py"
|
||||||
|
++ lib.optional (!withYapf) "test/plugins/test_yapf_format.py";
|
||||||
|
|
||||||
|
preCheck = ''
|
||||||
|
export HOME=$(mktemp -d);
|
||||||
|
'';
|
||||||
|
|
||||||
|
pythonImportsCheck = [ "pylsp" ];
|
||||||
|
|
||||||
|
meta = with lib; {
|
||||||
|
description = "Python implementation of the Language Server Protocol";
|
||||||
|
homepage = "https://github.com/python-lsp/python-lsp-server";
|
||||||
|
license = licenses.mit;
|
||||||
|
maintainers = with maintainers; [ fab ];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
@ -0,0 +1,29 @@
|
||||||
|
{ lib
|
||||||
|
, fetchPypi
|
||||||
|
, buildPythonPackage
|
||||||
|
, helpdev
|
||||||
|
, qtpy
|
||||||
|
}:
|
||||||
|
|
||||||
|
buildPythonPackage rec {
|
||||||
|
pname = "qdarkstyle";
|
||||||
|
version = "3.0.3";
|
||||||
|
|
||||||
|
src = fetchPypi {
|
||||||
|
inherit version;
|
||||||
|
pname = "QDarkStyle";
|
||||||
|
sha256 = "sha256-k20tNbVS9CmAOphdvBf8h5ovlm+qn7+Jg4lsz6M+aPY=";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
# No tests available
|
||||||
|
doCheck = false;
|
||||||
|
|
||||||
|
propagatedBuildInputs = [ helpdev qtpy ];
|
||||||
|
|
||||||
|
meta = with lib; {
|
||||||
|
description = "A dark stylesheet for Python and Qt applications";
|
||||||
|
homepage = "https://github.com/ColinDuquesnoy/QDarkStyleSheet";
|
||||||
|
license = licenses.mit;
|
||||||
|
maintainers = with maintainers; [ nyanloutre ];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
@ -0,0 +1,38 @@
|
||||||
|
{ lib
|
||||||
|
, buildPythonPackage
|
||||||
|
, fetchPypi
|
||||||
|
, nose
|
||||||
|
, isPy27
|
||||||
|
, mock
|
||||||
|
, traitlets
|
||||||
|
, jupyter_core
|
||||||
|
, jupyter-client
|
||||||
|
, pygments
|
||||||
|
, ipykernel
|
||||||
|
, pyqt5
|
||||||
|
, qtpy
|
||||||
|
}:
|
||||||
|
|
||||||
|
buildPythonPackage rec {
|
||||||
|
pname = "qtconsole";
|
||||||
|
version = "5.3.0";
|
||||||
|
|
||||||
|
src = fetchPypi {
|
||||||
|
inherit pname version;
|
||||||
|
sha256 = "sha256-jjUg/cdeRqvEzGz/7KFvomUnVBCbiug5+ijifR66ViU=";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
checkInputs = [ nose ] ++ lib.optionals isPy27 [mock];
|
||||||
|
propagatedBuildInputs = [traitlets jupyter_core jupyter-client pygments ipykernel pyqt5 qtpy];
|
||||||
|
|
||||||
|
# : cannot connect to X server
|
||||||
|
doCheck = false;
|
||||||
|
|
||||||
|
meta = {
|
||||||
|
description = "Jupyter Qt console";
|
||||||
|
homepage = "https://jupyter.org/";
|
||||||
|
license = lib.licenses.bsd3;
|
||||||
|
platforms = lib.platforms.unix;
|
||||||
|
maintainers = with lib.maintainers; [ fridh ];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
@ -0,0 +1,27 @@
|
||||||
|
{ lib, buildPythonPackage, fetchPypi, pyside, pytest, packaging }:
|
||||||
|
|
||||||
|
buildPythonPackage rec {
|
||||||
|
pname = "QtPy";
|
||||||
|
version = "2.1.0";
|
||||||
|
|
||||||
|
src = fetchPypi {
|
||||||
|
inherit pname version;
|
||||||
|
sha256 = "sha256-yozUIXF1GGNEKZ7kwPfnrc82LHCFK6NbJVpTQHcCXAY=";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
propagatedBuildInputs = [ packaging ];
|
||||||
|
|
||||||
|
# no concrete propagatedBuildInputs as multiple backends are supposed
|
||||||
|
checkInputs = [ pyside pytest ];
|
||||||
|
|
||||||
|
doCheck = false; # require X
|
||||||
|
checkPhase = ''
|
||||||
|
py.test qtpy/tests
|
||||||
|
'';
|
||||||
|
|
||||||
|
meta = with lib; {
|
||||||
|
description = "Abstraction layer for PyQt5/PyQt4/PySide2/PySide";
|
||||||
|
homepage = "https://github.com/spyder-ide/qtpy";
|
||||||
|
license = licenses.mit;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
@ -0,0 +1,32 @@
|
||||||
|
{ lib, buildPythonPackage, fetchPypi, cloudpickle, ipykernel, wurlitzer,
|
||||||
|
jupyter-client, pyzmq }:
|
||||||
|
|
||||||
|
buildPythonPackage rec {
|
||||||
|
pname = "spyder-kernels";
|
||||||
|
version = "2.3.0";
|
||||||
|
|
||||||
|
src = fetchPypi {
|
||||||
|
inherit pname version;
|
||||||
|
sha256 = "sha256-pdU20Oil53TX1hbBAqj6LWqkX9MwoLeZuY7vFYNW02w=";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
propagatedBuildInputs = [
|
||||||
|
cloudpickle
|
||||||
|
ipykernel
|
||||||
|
wurlitzer
|
||||||
|
jupyter-client
|
||||||
|
pyzmq
|
||||||
|
];
|
||||||
|
|
||||||
|
# No tests
|
||||||
|
doCheck = false;
|
||||||
|
|
||||||
|
meta = with lib; {
|
||||||
|
description = "Jupyter kernels for Spyder's console";
|
||||||
|
homepage = "https://docs.spyder-ide.org/current/ipythonconsole.html";
|
||||||
|
downloadPage = "https://github.com/spyder-ide/spyder-kernels/releases";
|
||||||
|
changelog = "https://github.com/spyder-ide/spyder-kernels/blob/master/CHANGELOG.md";
|
||||||
|
license = licenses.mit;
|
||||||
|
maintainers = with maintainers; [ gebner ];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
@ -0,0 +1,122 @@
|
||||||
|
{ lib, buildPythonPackage, fetchPypi, isPy27, makeDesktopItem, intervaltree,
|
||||||
|
jedi, pycodestyle, psutil, rope, numpy, scipy, matplotlib, pylint,
|
||||||
|
keyring, numpydoc, qtconsole, qtawesome, nbconvert, mccabe, pyopengl,
|
||||||
|
cloudpickle, pygments, spyder-kernels, qtpy, pyzmq, chardet, qdarkstyle,
|
||||||
|
watchdog, python-lsp-server, pyqtwebengine, atomicwrites, pyxdg,
|
||||||
|
diff-match-patch, three-merge, python-lsp-black, pyls-spyder, flake8, textdistance,
|
||||||
|
cookiecutter, libspatialindex, fetchFromGitHub, pbr, inflection, tinycss2, jellyfish,
|
||||||
|
autopep8
|
||||||
|
}:
|
||||||
|
|
||||||
|
buildPythonPackage rec {
|
||||||
|
pname = "spyder";
|
||||||
|
version = "5.3.0";
|
||||||
|
|
||||||
|
disabled = isPy27;
|
||||||
|
|
||||||
|
src = fetchPypi {
|
||||||
|
inherit pname version;
|
||||||
|
sha256 = "sha256-ggCFvYUdUm5fVSpTZoN/OhNPJAQOyehwrQprYTzprbc=";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
nativeBuildInputs = [ pyqtwebengine.wrapQtAppsHook ];
|
||||||
|
|
||||||
|
propagatedBuildInputs = [
|
||||||
|
intervaltree jedi pycodestyle psutil rope numpy scipy matplotlib pylint keyring
|
||||||
|
numpydoc qtconsole qtawesome nbconvert mccabe pyopengl cloudpickle spyder-kernels
|
||||||
|
pygments qtpy pyzmq chardet pyqtwebengine qdarkstyle watchdog python-lsp-server
|
||||||
|
atomicwrites pyxdg diff-match-patch three-merge python-lsp-black pyls-spyder
|
||||||
|
flake8 textdistance cookiecutter jellyfish autopep8
|
||||||
|
(
|
||||||
|
buildPythonPackage rec {
|
||||||
|
pname = "Rtree";
|
||||||
|
version = "1.0.0";
|
||||||
|
propagatedBuildInputs = [ numpy ];
|
||||||
|
src = fetchPypi {
|
||||||
|
inherit pname version;
|
||||||
|
sha256 = "sha256-0Eg0ghITRrCTuaQlGNQPkhrfRFkVt66jB+smdoyDloI=";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
doCheck = false;
|
||||||
|
patchPhase =
|
||||||
|
''
|
||||||
|
substituteInPlace rtree/finder.py --replace "_candidates = [" "_candidates = ['${libspatialindex}/lib',"
|
||||||
|
'';
|
||||||
|
}
|
||||||
|
)
|
||||||
|
(
|
||||||
|
buildPythonPackage rec {
|
||||||
|
pname = "qstylizer";
|
||||||
|
version = "0.2.1";
|
||||||
|
propagatedBuildInputs = [ pbr inflection tinycss2 ];
|
||||||
|
src = fetchFromGitHub {
|
||||||
|
owner = "blambright";
|
||||||
|
repo = "qstylizer";
|
||||||
|
rev = version;
|
||||||
|
sha256 = "sha256-iEMxBpS9gOPubd9O8zpVmR5B7+UZJFkPuOtikO1a9v0=";
|
||||||
|
};
|
||||||
|
preBuild = ''
|
||||||
|
export PBR_VERSION=${version}
|
||||||
|
'';
|
||||||
|
doCheck = false;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
)
|
||||||
|
];
|
||||||
|
|
||||||
|
# There is no test for spyder
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||||||
|
doCheck = false;
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||||||
|
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||||||
|
desktopItem = makeDesktopItem {
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||||||
|
name = "Spyder";
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||||||
|
exec = "spyder";
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||||||
|
icon = "spyder";
|
||||||
|
comment = "Scientific Python Development Environment";
|
||||||
|
desktopName = "Spyder";
|
||||||
|
genericName = "Python IDE";
|
||||||
|
categories = "Development;IDE;";
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||||||
|
};
|
||||||
|
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||||||
|
postPatch = ''
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||||||
|
# remove dependency on pyqtwebengine
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||||||
|
# this is still part of the pyqt 5.11 version we have in nixpkgs
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||||||
|
sed -i /pyqtwebengine/d setup.py
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||||||
|
# The major version bump in watchdog is due to changes in supported
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||||||
|
# platforms, not API break.
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||||||
|
# https://github.com/gorakhargosh/watchdog/issues/761#issuecomment-777001518
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||||||
|
substituteInPlace setup.py \
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||||||
|
--replace "pyqt5<5.13" "pyqt5" \
|
||||||
|
--replace "parso==0.7.0" "parso" \
|
||||||
|
--replace "watchdog>=0.10.3,<2.0.0" "watchdog>=0.10.3,<3.0.0"
|
||||||
|
'';
|
||||||
|
|
||||||
|
postInstall = ''
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||||||
|
# add Python libs to env so Spyder subprocesses
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# created to run compute kernels don't fail with ImportErrors
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|
wrapProgram $out/bin/spyder --prefix PYTHONPATH : "$PYTHONPATH"
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||||||
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||||||
|
# Create desktop item
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|
mkdir -p $out/share/icons
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cp spyder/images/spyder.svg $out/share/icons
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|
cp -r $desktopItem/share/applications/ $out/share
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|
'';
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||||||
|
dontWrapQtApps = true;
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|
preFixup = ''
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|
makeWrapperArgs+=("''${qtWrapperArgs[@]}")
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|
'';
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|
meta = with lib; {
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|
description = "Scientific python development environment";
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|
longDescription = ''
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|
Spyder (previously known as Pydee) is a powerful interactive development
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|
environment for the Python language with advanced editing, interactive
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||||||
|
testing, debugging and introspection features.
|
||||||
|
'';
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||||||
|
homepage = "https://www.spyder-ide.org/";
|
||||||
|
downloadPage = "https://github.com/spyder-ide/spyder/releases";
|
||||||
|
changelog = "https://github.com/spyder-ide/spyder/blob/master/CHANGELOG.md";
|
||||||
|
license = licenses.mit;
|
||||||
|
platforms = platforms.linux;
|
||||||
|
maintainers = with maintainers; [ gebner ];
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
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